Za meritve pretočnih hitrosti in globin so bili uporabljeni ultrazvočni merilec Starflow 6526B, hidrometrično krilo Valeport in ultrazvočni merilec v sestavi prenosnega vzorčevalnika voda ISCO 6700. Ultrazvočni merilec Starflow 6526B meri pretočne hitrosti (Dopplerjev pojav), globino in temperaturo. Hidrometrično krilo Valeport meri pretočne hitrosti na principu avtomatskega preračunavanja frekvenc vrtljajev vijaka v hitrosti preko enačbe hidrometričnega krila. Ima tudi senzorja za merjenje pritiska (na osnovi katerega izračuna globino) in temperature. Z zunanjim dodatkom za meritve hitrosti prenosni vzorčevalnik voda ISCO 6700 meri pretočne hitrosti na principu potovanja zvoka v vodi. Globine izmeri preko tlačne sonde, ki meri hidrostatski pritisk.

Za meritve kalnosti (vsebnosti suspendiranih snovi) smo uporabili turbidmeter Hach SS6, infrardeči merilec suspendiranih snovi Partech IR40 in prenosni vzorčevalnik vode ISCO 3700. Turbidimeter Hach SS6 je inštrument za neprekinjeno merjenje motnosti tekočin. Infrardeči merilec suspendiranih snovi Partech IR40 je podkvasto oblikovan in v njem je vgrajen infrardeči senzor za merjenje koncentracije lebdečih delcev [mg/l]. Prenosni vzorčevalnik vode ISCO 3700 je programabilen vzorčevalnik tekočin. Kakovostne parametre smo merili s prenosnim vzorčevalnikom vode ISCO 6700, ki poleg že omenjenih meritev hitrosti in globin z združljivo sondo YSI 600 meri še temperaturo, raztopljen kisik, pH in elektroprevodnost. V raziskavi strupenosti nas je zanimala strupenost potoka Trnovšek in strupenost reke Reke pod izlivom tega potoka. Vzorce iz Reke smo vzeli v letu 1999 dvakrat in sicer vsakokrat pred in po merjenem poplavnem valu (maj in november). Strupenost smo testirali s tremi testi strupenosti. To so Daphnotoxkit F^TM z vodnimi bolhami (Daphnia magna), Thamnotoxkit F^TM z drugo skupino sladkovodnih rakov Thamnocephalus platyurus in Protoxkit F^TM z enoceličnimi migetalkarji (protozoji) vrste Tetrahymena thermophila.
 

Meritve pretočnih globin, hitrosti in temperature smo opravili tedaj, ko je vremenska napoved v predhodnih dneh obetala nastop obilnih padavin in s tem pojav visoka voda. Ti termini so bili:

21.05.1999 - 24.05.1999,
16.11.1999 - 21.11.1999,
28.03.2000 - 05.04.2000, 
11.04.2000 - 17.04.2000 in

22.11.2001 - 24.11.2001.

Meritve hitrosti in globin so se izvajale na vodomerni postaji Cerkvenikov mlin, meritve kalnosti in kakovosti pa 1 km gorvodno v bližini opuščene vodarne. Ekotoksikološke meritve so bile opravljene posebej.